Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf4Q9DAW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf4Q9DAW6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf4Q9DAW6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf4Q9DAW6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms