Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ift43Q9DA69 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift43Q9DA69 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ift43Q9DA69 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift43Q9DA69 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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