Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem239Q9DA47 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem239Q9DA47 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem239Q9DA47 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms