Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sgf29Q9DA08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sgf29Q9DA08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sgf29Q9DA08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms