Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b2Q9D9N2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b2Q9D9N2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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