Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf138rt1Q9D9M9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms