Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D8Q6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D8Q6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D8Q6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms