Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8L0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8L0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8L0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8L0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms