Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Necab3Q9D6J4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Necab3Q9D6J4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Necab3Q9D6J4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Necab3Q9D6J4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Necab3Q9D6J4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Necab3Q9D6J4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab3Q9D6J4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms