Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt34Q9D646 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt34Q9D646 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt34Q9D646 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms