Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gins2Q9D600 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gins2Q9D600 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gins2Q9D600 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gins2Q9D600 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms