Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf1dQ9D4V4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf1dQ9D4V4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf1dQ9D4V4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf1dQ9D4V4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Taf1dQ9D4V4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Taf1dQ9D4V4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf1dQ9D4V4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms