Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930564D02RikQ9D4S4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930564D02RikQ9D4S4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms