Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc105Q9D4K7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc105Q9D4K7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc105Q9D4K7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc105Q9D4K7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms