Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrp2bpQ9D4C6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrp2bpQ9D4C6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 694.6 ms