Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933428M09RikQ9D3X3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933428M09RikQ9D3X3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4933428M09RikQ9D3X3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms