Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pus10Q9D3U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pus10Q9D3U0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms