Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsig1Q9D2J4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vsig1Q9D2J4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vsig1Q9D2J4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vsig1Q9D2J4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms