Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chordc1Q9D1P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chordc1Q9D1P4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms