Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdca7Q9D0M2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdca7Q9D0M2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdca7Q9D0M2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdca7Q9D0M2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms