Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nde1Q9CZA6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nde1Q9CZA6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nde1Q9CZA6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nde1Q9CZA6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms