Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed5Q9CXE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed5Q9CXE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmed5Q9CXE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmed5Q9CXE7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms