Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb2bQ9CWF2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb2bQ9CWF2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubb2bQ9CWF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms