Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fcf1Q9CTH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fcf1Q9CTH6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms