Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dis3Q9CSH3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dis3Q9CSH3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dis3Q9CSH3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms