Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl20Q9CQL4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl20Q9CQL4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl20Q9CQL4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms