Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufb5Q9CQH3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufb5Q9CQH3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufb5Q9CQH3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms