Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RTRAFQ9CQE8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTRAFQ9CQE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTRAFQ9CQE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms