Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim11Q99PQ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim11Q99PQ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim11Q99PQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim11Q99PQ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms