Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn6Q99PL6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn6Q99PL6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms