Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh23Q99PF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh23Q99PF4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh23Q99PF4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh23Q99PF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh23Q99PF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh23Q99PF4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh23Q99PF4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh23Q99PF4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh23Q99PF4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms