Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arl4dQ99PE9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arl4dQ99PE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arl4dQ99PE9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl4dQ99PE9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl4dQ99PE9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl4dQ99PE9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arl4dQ99PE9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms