Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Nup155Q99P88 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Nup155Q99P88 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup155Q99P88 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nup155Q99P88 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup155Q99P88 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms