Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rnf17Q99MV7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rnf17Q99MV7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rnf17Q99MV7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rnf17Q99MV7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms