Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncaipQ99ME3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SncaipQ99ME3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms