Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gdpd3Q99LY2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gdpd3Q99LY2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gdpd3Q99LY2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms