Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TriobpQ99KW3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TriobpQ99KW3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TriobpQ99KW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms