Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Reep3Q99KK1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Reep3Q99KK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms