Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad3Q925I1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad3Q925I1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad3Q925I1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad3Q925I1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atad3Q925I1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atad3Q925I1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atad3Q925I1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atad3Q925I1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms