Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Clip1Q922J3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Clip1Q922J3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Clip1Q922J3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Clip1Q922J3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Clip1Q922J3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms