Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cts3Q91ZD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cts3Q91ZD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cts3Q91ZD5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cts3Q91ZD5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms