Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc1Q91Z38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc1Q91Z38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms