Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrp1bQ91YK2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rrp1bQ91YK2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1bQ91YK2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp1bQ91YK2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms