Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdha12Q91Y18 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdha12Q91Y18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdha12Q91Y18 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms