Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ8

Pcdhb22, Protocadherin beta 22, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb22Q91XZ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdhb22Q91XZ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pcdhb22Q91XZ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdhb22Q91XZ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcdhb22Q91XZ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms