Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp9Q91WM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrp9Q91WM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rrp9Q91WM3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrp9Q91WM3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms