Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc65Q8VHI7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc65Q8VHI7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms