Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cabp4Q8VHC5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp4Q8VHC5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp4Q8VHC5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp4Q8VHC5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms