Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot6lQ8VEG6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnot6lQ8VEG6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6lQ8VEG6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnot6lQ8VEG6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms