Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt79Q8VED5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt79Q8VED5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt79Q8VED5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms